改革开放以来，历届昌平区委、区政府始终坚持把科学技术置于优先发展的战略地位，先后将“科教兴昌”和“科教文主导战略”纳入区域发展的总体思路，并在昌平新城规划中进一步明确了“科教创新基地”的功能定位，通过持续深化认识，全力推动实施，全区科技工作水平不断提升，科技创新能力不断增强，科技发展后劲不断夯实，培育和造就了一大批创新型人才、创新型企业和创新型产业基地。
截至目前，全区已拥有中关村科技园区昌平园、生命科学园、国家工程技术创新基地等6个国家级和市级科技产业园区，聚集了包括中石油等大型企业以及神雾热能等高成长性中小企业在内的1500多家高新技术企业，以园区为载体、企业为主体、产学研合作为特色的科技创新格局初步形成。同时，始终坚持高端、高效、高辐射力的产业发展方向，充分发挥科技创新的主导作用，以科技创新为引领，高端化发展的区域产业结构调整成效明显。2008年，全区高新技术产业完成总收入605亿元，上缴税收28亿元，高新技术产业已经成为支撑区域经济发展的主要力量；在鼓励科技创新工作中，充分发挥政府部门的职能作用，以政府为主导，引入市场机制、各方面共同参与的科技创新服务体系不断健全，研究出台了一系列促进中小企业创新发展的扶持措施，为推进科技进步和创新提供了有效的体制、政策和资金保障。截至目前，全区已有150多家企业获得高新技术认定费用补贴，共为企业融资5.1亿元，担保额度达到了7.3亿元；全面实施人才战略，深入开展科普工作，以核心技术产品为代表，拥有自主知识产权的科技创新成果持续涌现。2008年，全区专利申请总量、专利授权总量、技术输出总额均位居全市十八区县前列。
今后一个时期，全区科技创新工作要以科学发展观为指导，紧紧围绕“三个北京”建设和打造商务花园城市的要求，大力发展实验室经济，加快构建产学研一体化区域创新体系，进一步整合科技创新资源；以打造“金十字“高科技产业走廊为抓手，进一步筑牢科技创新载体；以调整优化区域产业结构为重点，进一步提升科技创新水平；以打造首都人才新高低为目标，进一步增强科技创新活力，在全区着力营造支持创新、激励创新和崇尚创新的政策服务环境、投融资环境和社会文化环境，为建设创新型昌平提供坚强保障。
